骨科位于住院部9楼，是安徽省脊柱内镜联盟成员单位，安徽省足踝联盟成员单位，皖西地区足踝中心。 

  科室拥有C型臂、关节镜、脊柱内镜、显微镜、足踝专业器械等各种专科设备。常规开展四肢脊柱复杂骨盆骨折、人工髋、膝、肩关节置换手术；颈椎病、腰椎间盘突出症、腰椎滑脱等脊柱手术；其中以骨科微创手术为特色，如：手足畸形矫形手术（踇外翻（微创二代Puls技术为市内领先）、多/并指（趾）、马蹄内翻足、高弓足等）、跟骨骨折微创治疗（关节镜辅助下，该项技术市内领先），脊柱微创手术（如椎间孔镜髓核摘除术，UBE（单侧双通道内镜技术）下进行椎间盘突出髓核摘除、椎管狭窄减压、脊柱融合术，脊柱椎体骨折、血管瘤等疾病的椎体成形术），关节镜等微创手术治疗。

  安徽医科大学第二附属医院骨科定期在我科坐诊、手术、查房、教学。并与中国科学技术大学附属第一医院，安医一附院保持长期合作关系。